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Vitamin A and regulation of gene expression

赵 丹综述 孙长颢审校哈尔滨医科大学公共卫生学院;营养与食品卫生教研室,哈尔滨 150086

  维生素A类是指含有视黄醇结构,并具有其生物活性的一大类物质,包括已形成的维生素A和维生素A原以及其代谢产物。类维生素A是指视黄醇及其代谢产物以及合成类似物。哺乳动物体内具有视黄醇生物活性功能的类维生素A包括视黄醇、视黄醛和视黄酸。
  在生物体内,维生素A呈现多种作用,如调节胚胎发育、调节细胞增殖分化和抗炎症等作用,而这些作用往往都是通过视黄酸调节靶细胞靶基因的表达实现的。
  很久以来,一直认为类维生素A可直接调节靶组织内的特定基因的表达。但是,近十几年来,成功克隆并识别了类维生素A受体后,发现类维生素A并非直接调节靶基因,而是通过其受体间接调节基因的表达。而且,类维生素A调节基因表达具有自身的特点,类维生素A受体与靶基因的启动子具有高度的亲和力,在没有结合配体的情况下便与反应基因结合,经配体--维生素A活化后,才发挥转录因子的作用。
  类维生素A受体包括视黄酸受体(retinoic acid receptor RARs)和类维生素A X受体(retinoid X receptor RXRs),它们属于类固醇激素核受体超家族。RARs和RXRs是配体依赖性转录因子,它们调节基因表达的方式有两种:(1)与位于启动子的视黄酸反应元件(retinoic acid response elements,RAREs)结合上调基因的表达;或(2)通过与某些转录因子结合,如AP1和NFIL6,拮抗增强子的作用,从而下调基因的表达。
  RARs和RXRs均具有3种不同的亚型(α,β和γ),它们分别由不同的基因编码。RARs可被全反式视黄酸和9顺式视黄酸激活。每种RAR由于N端的A区的不同又分出几种异构体。RAR α主要有2种异构体(α1和α2),RARβ具有4种异构体(β1、β2、β3和β4),RARγ具有两种异构体(γ1和γ2)。和RARs一样,RXRs也可以由一个基因的表达产物衍变出多种异构体。

1 RARsRXRs的结构
  与大部分核激素受体相同,RAR的分子结构由6个保守区域构成,它们分别是AF区。
C区是第一高度保守区,该区为DNA结合结构域(DNA binding domain DBD),其中含有DNA识别序列。
  E区是第二个高度保守区,相对应的称作配体结合结构域(ligand binding domain,LBD)。由于既含有配体结合口袋,又是主要的二聚化结构域,又含有配体依赖的反式激活因子(AF2),所以是多功能复合体。
  AB区的N端具有配体依赖性转录激活因子(AF1)。
  D区是构成DBD和LBD之间的铰合部,也称铰链,其作用是允许DBD自由旋转。由于D区的存在,DBD和LBD可以排除空间阻遏的问题形成不同的构象。
  RARs含有F区,RXRs不含有F区。F区的作用还不清楚。但是,该区域可被磷酸化,据推测可能与雌激素受体一样,它可能参与调节AF1和AF2的功能。

2 RARRXR对基因表达调控的机制
  大量研究表明,要激活某一基因的表达,类维生素A受体必须与染色质阻遏结构相抗衡。实际上,大部分靶基因处于休眠状态时均呈现密集的染色质结构,结合了配体的类维生素A受体参与构成一组蛋白复合体,包括辅助激活因子、开链因子和修饰因子,它们协同作用和/或以结合形式将染色质解压缩,引导RNA聚合酶Ⅱ和通用转录因子(general transcription factor,GTFs)结合到启动子上。下面,将其调节过程分为3个步骤详细说明。
  第一步:类维生素A受体与位于靶基因调节序列的反应元件结合
  在没有配体的情况下,类维生素A受体主要存在于细胞核内。它们以不对称的RAR/RXR异源二聚体形式与特异性DNA序列或视黄酸反应元件(RAREs)结合。RXR同源二聚体和RAR/RXR异源二聚体通过DBD与DNA深沟结合。结合后通过DBDs之间的协同作用,使蛋白蛋白、蛋白DNA之间的相互作用得到增强。为了结合不同的反应元件,受体DBD可根据RARE的间隔利用不同区域产生不同的二聚化内表面,以提高DNA结合效率。
  第二步:配体结合,辅助激活因子掺入和染色质解链
  在没有结合配体——类维生素A时,类维生素A受体实际上发挥转录辅助抑制因子的作用。核小体结构不影响RARRXR异源二聚体与其DNA识别序列结合,未结合配体的类维生素A受体通过招募一些辅助抑制因子(如NcoR和SMRT)发挥抑制基因转录的作用。这些辅助抑制因子可构成或掺入到某些高分子量复合体当中,高分子复合体具有组蛋白脱乙酰基酶的活力,脱乙酰基作用可增加组蛋白N端与核小体DNA的相互作用,维持染色质的紧密结构。
  为了激活基因的表达,启动转录机制,类维生素A受体必须与紧密的染色质结构抗衡。类维生素A受体与配体结合后,配体诱导的受体构象改变可导致辅助抑制因子与DNA分离,或同时结合辅助激活因子,并在此基础上形成大的复合体,从而使紧密的染色质结构解压缩,暴露出启动子,启动转录。
  第三步:转录前起始复合物的形成
  密集的染色质结构一旦被解压缩,辅助调节因子的交换就发生了,辅助因子释放后,类维生素A受体就可以与所谓的SMCCSrb and mediator protein containing complex中间蛋白复合物结合,募集参与形成转录前起始复合物的分子。中间蛋白复合物的形成加速了转录前起始复合物与启动子的结合,结合过程通过RNA PolⅡ全酶与启动子的识别实现。此外,该过程还需要6个GTFs的参与。转录起始过程一旦启动,RNA PolⅡ就沿着转录的基因向下游滑动。此过程中,染色质处于松散的状态,同时需要延长因子和RNA PolⅡ的参与。最后,组蛋白尾脱乙酰基,氨基酸残基甲基化,导致染色质重新恢复紧密的结构。

3 类维生素A受体介导的其他调节方式
3.1 泛素-蛋白酶体系统降解类维生素A受体,通过类维生素A受体数量的改变调节基因表达泛素-蛋白酶体系统的主要作用是降解转录因子。最近研究表明,RARRXR异源二聚体与反应元件结合后,在类维生素A的作用之下,二者均可被蛋白酶体降解。在降解过程中,首先RARs被泛素化,然后蛋白酶体结合到AF2功能区上,降解RARs。据推测,该降解机制可能是类维生素A调节基因转录的机制之一。其可能的机制是破坏转录起始复合物从而进入延伸过程,或者激发了其它更为快速有效的转录过程。
3.2 类维生素A受体磷酸化介导的转录调节
  2002年,又发现了一种新的类维生素A受体调节方式,即磷酸化调节。类维生素A受体可以通过磷酸化参与多种信号通路,也可以认为类维生素A是多种信号传导通路的共同分子。
  RARs和RXRs是很多激酶的底物。与TFⅡH作用之后,RARsRARα和RARγN端的AB区被TFⅡH的cdk7亚基磷酸化,TFⅡH具有细胞周期蛋白依赖的蛋白激酶活性。研究表明,TFⅡH亚基突变可导致cdk7激酶不能催化其底物的磷酸化反应,导致RARα不能磷酸化,依赖类维生素A的转录过程被迫减少。磷酸化可能促进转录起始复合物的形成,稳定转录起始复合物,促进转录过程。但是,不排除磷酸化后,RARα同转录抑制因子分离的可能,也不排除磷酸化后RARα从转录起始复合物上释放,从而进入延伸过程的可能。
  在某些情况下RARγ亚型虽然必须被TFⅡH磷酸化,但是反应量不大。实际上RARγ还需要另外一个氨基酸残基位点被p38MAPK磷酸化,然后才能够被类维生素A激活。RARγ的反式激活和降解都需要两处氨基酸残基的磷酸化。
此外 ,在其它信号的刺激下,RARα和RARγ的转录活性也能够被其它激酶磷酸化调节。实际上,位于螺旋H9和H10之间的丝氨酸369被PKA磷酸化后,可上调RARα的转录活性,磷酸化后可能增强了辅助调节因子与RARRXR异源二聚体的结合,或增强了DNA与RARRXR异源二聚体结合。在PKC信号的刺激下,RARαDBD的磷酸化有助于异源二聚体的形成和与DNA的结合。

4 类维生素A受体RXR与其它信号通路的交连对话
  RXRs除了可以与RARs形成异源二聚体外,还可以与其它几个核受体,如过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)和肝X受体(liver X receptor,LXR)形成异源二聚体,因此它可以广泛的参与基因表达的调节。
  而且,类维生素A靶基因启动子除了含有RAREs外,往往还含有其它调节序列,它们可以与其它转录激活因子结合。如,在细胞因子存在的情况下,信号传导子和转录激活因子5(signal transductors and activator of transcription 5,STAT 5)与RA-靶基因的相互作用可以达到最大的转录效率。这种协同作用的产生很可能就是多个辅助调节因子同时作用的结果。

5 类维生素A调节基因及其实际意义
  通过差异显示法、差减杂交法或基因微阵列分析技术,发现了很多类维生素A调节基因(见表1)。其中包括类维生素A受体、参与维生素A代谢的酶类,以及其它物质代谢的关键酶。因此,维生素A在体内可以参与调节其它物质的代谢,发挥着类似于″激素″样的作用。


  类维生素A可抑制某些异常分化或炎症相关基因的表达。因此类维生素A可用于治疗肿瘤和痤疮。例如,IL6,卡波氏肉瘤细胞的自分泌生长因子,由于类维生素A可以下调其表达,因此临床上用于治疗卡波氏肉瘤。
  RXR特异性配体,还可以激活RXRPPARγ异源二聚体的转录反应,具有降糖和降脂的作用。并且,联合使用RXR和PPARγ特异性配体具有协同作用。目前,已经有采用RXR和PPARγ特异性配体治疗糖尿病和其它代谢性疾病的报道。
  此外,类维生素A在胚胎发育过程中也具有十分重要的作用。如在胚胎发育的过程中,通过调节同源异性盒基因(homeobox基因)家族成员Hox基因在不同组织内的时空特异性表达,保证器官组织的正常发育,防止畸形或出生缺陷的发生2。

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